Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms