Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL10A1Q03692 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms