Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms