Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms