Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms