Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms