Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms