Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms