Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA52P62987 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms