Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms