Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCS1P62166 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCS1P62166 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms