Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms