Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP9P55211 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP9P55211 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms