Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms