Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP12AP54707 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms