Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms