Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RBP2P50120 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBP2P50120 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms