Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIM1P49642 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms