Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FNTAP49354 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FNTAP49354 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FNTAP49354 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms