Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms