Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRATP43155 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRATP43155 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms