Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCAMP43121 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms