Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms