Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNA7P36544 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms