Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms