Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms