Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA7P31268 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms