Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms