Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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