Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms