Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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