Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD53P19397 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD53P19397 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD53P19397 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CD53P19397 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms