Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2CP19387 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms