Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms