Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODC1P11926 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODC1P11926 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODC1P11926 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms