Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms