Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CT47B1P0C2W7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CT47B1P0C2W7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms