Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFMP07197 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEFMP07197 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEFMP07197 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms