Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGF1P05230 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGF1P05230 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGF1P05230 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms