Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TK1P04183 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TK1P04183 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TK1P04183 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms