Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOA1P02647 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOA1P02647 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms