Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED1O96006 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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