Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms