Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms