Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPLO60437 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPLO60437 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPLO60437 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPLO60437 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms