Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms