Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR3O43761 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms