Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms