Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CRXO43186 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CRXO43186 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CRXO43186 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CRXO43186 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CRXO43186 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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