Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms